EOS M6采用了广受好评的佳能全像素双核CMOS AF技术,它是继EOS M5后第二款使用该技术的EOS M机型。由佳能自主研发的全像素双核CMOS AF(Dual Pixel CMOS AF)是一项像面相差检测自动对焦技术,CMOS图像感应器的每个像素都配备两个光电二极管,从而可以捕捉相位不同的两个图像信号,实现如同光学取景器拍摄时的相差检测自动对焦。由于全部像素都支持相差检测,可获得详细的被摄体距离信息,实现高精度被摄体追踪。对焦范围的长和宽分别为实时显示画面的约80%,方便先构图后对焦。即使被摄体处于自动对焦有效范围的边缘也能直接对焦。相对传统的反差检测自动对焦,该技术在对焦速度和精度上都实现明显改进。
EOS M6采用佳能EOS系列积累的自动对焦算法,可强效预测被摄体动态。与高精度算出被摄体距离信息的全像素双核CMOS AF联动,可结合被摄体动作和速度提高自动对焦精度,实现了对动态被摄体的高追踪性能,而且可以在自动对焦追踪时进行连拍。其次,配合DIGIC 7影像处理器,即使被摄体大小和方向发生变化,也可实现高精度追踪对焦,同时自动对焦框的大小也可调整,以实现更精细的自动对焦效果。此外,在拍摄微距和人像时,可实现对焦区域的放大显示并进而精细调节对焦框的位置,实现高精确度的自动对焦效果。EOS M6对于主被摄体的检测性能也有所加强,特别是在主被摄体与背景颜色相近,或者饱和度低的情况下,依然可以准确检测到拍摄主体,并进行快速对焦。